Скорее всего, в этой прошивке, программа статистики просто не улавливает момент когда MCD отписывается от прослушивания GPS.
MCD и GPS уже выключены, а статистика считает что GPS включен и продолжает считать расход которого нет.
Сравнивать с навигационными программами не совсем корректно потому, что у них слушатель GPS работает в основном окне программы, а у MCD он работает в фоновом сервисе. Возможно, программа статистики нормально улавливает отписку от прослушивания в основном окне и не видит отписку если она идет из фонового сервиса.
Кстати, если сервис прибить каким нибудь таск киллером, то отписаться он просто физически не успеет. Ничего страшного в таком случае не произойдет, но программы статистики могут видеть слушатели оставшиеся в системе и некорректно их учитывать.