Полагаю, что тут все просто. В магнитоле, обычно есть несколько позиций для источника звука. А в настройках программы McD, тоже несколько каналов аудио. Таким образом, в программе, по умолчанию, стоит канал МУЛЬТИМЕДИА. Это значит, что предупреждение будут проходить на магнитолу, если выбран источник по синезубу. Если же магнитола используется с источником ТЮНЕР, ДИСК или USB, то она принимает в этих режимах только звонки со смарта. Значит, надо в настройках программы выбрать аудиоканал рингтон, тогда магнитола будет видеть сообщения, как входящие звонки, и транслировать их на акустику.